Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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