Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KNOP1Q1ED39 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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