Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC142Q17RM4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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