Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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