Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP6Q16828 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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