Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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