Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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