Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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