Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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