Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLC10A1Q14973 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms