Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GBX1Q14549 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms