Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTCH1Q13635 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTCH1Q13635 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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