Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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