Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD4Q13485 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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