Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms