Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAMSAP2Q08AD1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAMSAP2Q08AD1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms