Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE4DQ08499 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms