Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms