Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CDK5Q00535 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms