Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NESP48681 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NESP48681 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NESP48681 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NESP48681 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NESP48681 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms