Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMPOP42166 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms