Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTN2P35609 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms