Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFC1P35251 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFC1P35251 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFC1P35251 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFC1P35251 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFC1P35251 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFC1P35251 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFC1P35251 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFC1P35251 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFC1P35251 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFC1P35251 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFC1P35251 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms