Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms