Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKBIAP25963 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms