Protein–RNA interactions for Protein: P24311

COX7B, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7BP24311 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
COX7BP24311 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
COX7BP24311 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms