Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCL2P13500 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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