Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BMP3P12645 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BMP3P12645 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BMP3P12645 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms