Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOP2AP11388 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms