Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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