Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PRRX1-207ENST00000497230 3501 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GRM4-201ENST00000374177 3590 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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