Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC169A6NNP5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms