Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms