Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
A4D1N5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
A4D1N5 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms