Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF22A3QJZ6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF22A3QJZ6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF22A3QJZ6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF22A3QJZ6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRAMEF22A3QJZ6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF22A3QJZ6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms