Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KL1Q9Y6S9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KL1Q9Y6S9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms