Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX9Q9Y5X1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX9Q9Y5X1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX9Q9Y5X1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms