Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms