Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A6Q9Y2P4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms