Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3BQ9Y2G0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3BQ9Y2G0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFR3BQ9Y2G0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFR3BQ9Y2G0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFR3BQ9Y2G0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms