Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC5Q9UQL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC5Q9UQL6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC5Q9UQL6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC5Q9UQL6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms