Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVW-1Q9UQF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms