Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB9

AURKC, Aurora kinase C, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKCQ9UQB9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AURKCQ9UQB9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AURKCQ9UQB9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AURKCQ9UQB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms