Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP18Q9UMW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP18Q9UMW8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP18Q9UMW8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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