Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF112Q9ULX5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF112Q9ULX5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms