Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC7AQ9ULT0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC7AQ9ULT0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms