Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLXNB3Q9ULL4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXNB3Q9ULL4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXNB3Q9ULL4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms