Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH9Q9ULB4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms