Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA11Q9UKX5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA11Q9UKX5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms