Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF223Q9UK11 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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